قصة انمي Night Head 2041 تتابع القصة الإخوة “كيريهارا” الذين تم احتجازهم منذ صغرهم في منشأة علمية مآمنة بسبب قوتهم الخارقة للطبيعة، بعد أن هربوا من الحاجز الذي كان يمنعهم من استخدام قدراتهم، يبدأ الإخوة “كوروكي” مطاردتهم للإخوة “كيريهارا”.